近期，青岛农业大学动物医学院单虎教授团队在《Virology》发表研究性论文，揭示了塞尼卡病毒内部核糖体进入位点（IRES）与起始密码子（AUG）之间核苷酸数量对于病毒拯救及复制的影响。《Virology》是国际病毒学会的官方学术杂志，与《Journal of Virology》和《Journal of General Virology》并称为“病毒学三大期刊”。这是学院首次以第一单位在《Virology》上发表学术论文。团队负责人单虎教授和刘拂晓副教授为共同通讯作者，研究生王奇为共同第一作者。

塞尼卡病毒是一种新发病毒，可导致猪的水疱型临床病变，我国于2015年首次在广东省的猪场暴发塞尼卡病毒病。该病毒的基因组本质上是一条单股、正链、线性mRNA，不含5’帽子结构，但包含病毒特有的IRES序列。IRES序列的3’末端为假结结构，该结构与起始密码子AUG之间有13个核苷酸（13 nt）间隔。单虎教授团队通过反向遗传技术，对塞尼卡病毒cDNA克隆的13 nt序列进行了逐一敲除，并将核苷酸缺陷型cDNA克隆转染BSR细胞，试图拯救重组病毒。结果表明，塞尼卡病毒的13 nt序列最多容忍五个核苷酸的缺失。即便如此，由于RNA病毒的不保真特性，只有1 nt和2 nt缺失型病毒可以稳定传代，其它三株复活的病毒在13 nt序列处皆有核苷酸突变或增加。该研究揭示了1、2、3 nt缺失型病毒的复制特性。结果表明，只有1 nt缺失型病毒的生长曲线类似于野生型病毒，说明当13 nt序列缺失两个核苷酸的时候，已经对病毒的生长造成影响。

小RNA病毒科成员IRES不依赖于5’帽子结构启动蛋白翻译，因此IRES和AUG之间的序列对于核糖体启动蛋白翻译至关重要，然而鲜有研究证明其核苷酸距离对于病毒复制的影响。单虎教授团队创新性地对塞尼卡病毒13 nt序列进行了深入探究，并提出假想模型，即IRES-AUG距离影响病毒起始密码子在核糖体中的准确定位。

该研究受“十三五”重点研发项目（2016YFD050110404）和青岛农业大学人才科研启动经费（1120045）资助。单虎教授团队主要致力于病毒性疾病的研究工作，团队刘拂晓博士目前从事塞尼卡病毒和犬瘟热病毒分子机制的研究，其研究目的是通过病毒反向遗传技术揭示二者的复制、致病等分子机制。

论文链接：https://doi.org/10.1016/j.virol.2021.09.002